Od 2003 r. jest regulowana normami Systemu Zarządzania Jakością ISO 9001:2000. Aktualnie EN ISO 9001:2015, w ramach certyfikacji prowadzonej przez TÜV NORD.

Ważną pomoc w optymalizacji pracy Spółki, również pod kątem jakości, stanowi zintegrowany system zarządzania klasy ERP, wdrożony w 1999 roku i od tego czasu stale rozwijany oraz rozbudowywany o nowe moduły i funkcjonalności.
Od 2015 r. Spółka wprowadza kolejny projekt związany z zagadnieniem jakości, mający na celu efektywne zarządzanie produkcją – Lean Manufacturing.

Certyfikat ISO obejmuje swoim zakresem całość działalności Wikpolu, tj. projektowanie, produkcję oraz serwis. Firma podlega recertyfikacji co trzy lata, natomiast rokrocznie poddawana jest audytowi nadzoru. Księga jakości prowadzona jest elektronicznie.