Seit 2003 geregelt im Rahmen der vom TÜV NORD durchgeführten Zertifizierung durch die Normen des Qualitätsmanagementsystems ISO 9001:2000, gegenwärtig EN ISO 9001:2015.

Ein wichtiges Hilfsmittel zur Optimierung der Tätigkeit von Wikpol, auch im Hinblick auf die Qualität, ist das integrierte Managementsystem für ErP-Energieeffizienzklassen, das im Jahr 1999 implementiert wurde und seitdem ständig weiterentwickelt und um neue Module und Funktionalitäten erweitert wird.
Seit 2015 führte das Unternehmen ein weiteres Projekt im Bereich der Qualitätssicherung ein, das auf ein effektives Produktionsmanagement abzielt – Lean Manufacturing.

Das ISO-Zertifikat deckt alle Tätigkeiten von Wikpol ab, d. h. Konstruktion, Produktion und Service. Das Unternehmen unterzieht sich alle drei Jahre einer Rezertifizierung und wird zudem jedes Jahr einem Überwachungsaudit unterzogen. Das Qualitätshandbuch wird elektronisch geführt.